最初の集中治療から2～3週間後に、
残りの白血病細胞を破壊するための追加治療（地固め化学療法）を行います。
薬剤を追加するか、最初の治療と同じ組み合わせで、数週間にわたって数回の投与を行います。
この後さらに、薬の種類や用量を減らした維持化学療法を2～3年続けることもあります。
特定の染色体変異があるために再発のリスクが高い場合は、
最初の寛解期間に幹細胞移植を行うことが勧められます。
血液、骨髄、脳、精巣などに白血病細胞が再び現れることがあります（再発）。
骨髄に再び現れた場合は特に深刻です。化学療法を再開すると、
ほとんどの場合は効果が得られますが、この病気は再発する傾向が強く、
2歳未満の乳幼児や、成人では特に再発が多くみられます。
白血病細胞が脳に現れた場合は、週に1、2回、脳脊髄液に薬剤を注入します。
白血病細胞が精巣に現れた場合は、化学療法とともに放射線療法を行います。
再発した場合は、高用量の化学療法と同種幹細胞移植を併用すると治癒する可能性が最も高くなりますが、
この方法は組織のタイプ（HLA）が適合している人から幹細胞を得られる場合しか実施できません。
幹細胞のドナー（提供者）は多くの場合は兄弟や姉妹ですが、
HLAが適合する他人から提供を受ける場合もあります。
ときには、HLAが部分的に適合する家族や他人から細胞の提供を受けたり、
臍帯血（さいたいけつ：へその緒に含まれる血液）の幹細胞を使用することもあります。
幹細胞移植は65歳以上の人にはほとんど行われません。高齢者では成功率が低く、
副作用で命を失うリスクも高くなるからです。
幹細胞移植を実施できない再発患者には追加治療を行いますが、しばしば治療に体が耐えられず、
効果も得られにくくなり、治療でかえって病気が悪化したように感じることもよくあります。
しかし、中には寛解するケースもあります。
治療が有効でない場合は、終末期のケアを考える必要があります。
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