消化管の疾患の中には手術などの緊急の治療を要する致死的な病気が多くあります。
特に激しい腹痛は、多くの場合、緊急の処置が必要となります。
腹痛があればまず原因を突き止め、治療の目的で緊急の開腹手術をすべきか、
あるいは診断および検査結果が出るまでは手術を待つべきかが判断されます。
腹部の緊急手術が行われるケースとしては、
腸管の閉塞に伴う激しい腹痛、胆嚢（たんのう）、
虫垂、腸などの臓器の破裂、膿瘍（感染症によって膿がたまった状態）などが挙げられます。
消化管出血
出血は口から肛門までの消化管のどの部位にも起こる可能性があり、
その原因はさまざまです。
出血は便や嘔吐物の中に混じって見えるものもあれば、
検査で確認しなければわからないもの（潜在性）もあります。
動脈と静脈との異常な連絡（動静脈奇形）は胃や小腸、大腸にできます。
このような異常血管はもろくて破裂しやすく、
出血がだらだら続くこともあります。
特に高齢者では大出血を起こすことがあります。
食道の静脈が拡張して蛇行した食道静脈瘤（じょうみゃくりゅう）は、
血管がもろいため出血しやすくなっています。
アスピリンやその他の非ステロイド性抗炎症薬（NSAIDs）といった薬は、
消化管を刺激して出血をもたらすこともあります。
また血液が固まらないようにする薬（抗凝固薬）や
一度固まってしまった血液を溶かす薬
（ストレプトキナーゼや組織プラスミノーゲン・アクチベータといった血栓溶解薬）
を服用している場合も消化管出血を起こすことがあります。
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